A história desta igreja – e da cidade de Carlos Barbosa – tem início em 1883, com a primeira construção, em madeira, no lote de número 35 da Primeira Seção da Estrada Geral, da Colônia de Conde d’Eu. Localizava-se na esquina formada pelas atuais ruas Júlio de Castilhos e Antônio Adriano Guerra. Assinalou o centro religioso de uma incipiente comunidade, que passou a ser denominada de Trinta e Cinco. Esta mesma comunidade viu o progresso chegar bem pertinho dali, com a construção da Estação Férrea, inaugurada em dezembro de 1909.
Em 1916, a primitiva igreja foi substituída pela segunda construção, em alvenaria. Feita no mesmo local, esta construção atendeu à celebração de missas até a década de 1940, quando foi construída a terceira e atual igreja.
A Igreja Nossa Senhora Mãe de Deus teve a bênção de sua pedra fundamental em 1943, e foi inaugurada em maio de 1947. Sedia a Paróquia de mesmo nome, criada em 1948.
