A comunidade de Santa Luiza foi formada a partir da chegada de imigrantes boêmios, da região ocidental da atual República Tcheca, e suíços, no ano de 1878. A partir de 1882, os padres jesuítas começaram a visitar a localidade para celebrar a Eucaristia, e então teve início o planejamento de construção de uma capela, que foi concluída e benta apenas em 1887, devido às dificuldades da época. Era feita de tijolos fabricados no local e madeira serrada manualmente.
O templo dedicado a São João Nepomuceno, martirizado na Boêmia, já que provavelmente os moradores conheciam sua história e eram devotos desse santo. Já a denominação da localidade “Santa Luiza” é anterior à colonização, tendo sido escolhida pelo Conde Paulo de Montravel para designar todo o distrito de Coelho da Colônia Santa Maria de Soledade.
No ano de 1905 iniciou-se a construção da segunda capela, que foi concluída no ano de 1910. Ela permanece até os dias atuais.