São Rafael é uma comunidade pequena, mas bem antiga. Situa-se à margem direita do Arroio Boa Vista. Os primeiros imigrantes italianos chegaram ao local entre 1879 e 1880.
No ano de 1899 foi construída nesta comunidade a primeira capela de forma oficial, com licença do pároco e do bispo. A segunda edificação, também em madeira como a primeira, foi construída em 1938. Ambas situavam-se no lote 30 da ala norte da Linha Boa Vista.
A atual capela foi edificada em 1962, desta vez em alvenaria, e em novo local, no lote 28 norte. A partir dessa construção, o cemitério foi transferido para o mesmo local. Foi construído ainda o salão social, em 1970, formando assim o atual núcleo da comunidade.
O padroeiro São Rafael é invocado pelo poder de cura de todos os tipos, e a comunidade desde seu princípio leva esse nome como denominação oficial.