Santo Antônio de Santa Clara Baixa é o berço da imigração suiço-valesana no Rio Grande do Sul. Os primeiros moradores da localidade eram do Cantão do Valais. Eles se estabeleceram no local no ano de 1874, antes da grande imigração ocorrida a partir de 1875. No ano de 1881, os moradores reuniram-se para elaborar o estatuto e o regulamento visando disciplinar a construção de uma capela, demonstrando sua organização. Após algumas dificuldades, a construção foi efetivada apenas em 1910, ano em que foi elaborado um novo estatuto da sociedade da capela em honra a Santo Antônio de Pádua.
Em 1936 foi edificada a segunda capela, contando com a dedicação de várias pessoas, que fizeram todo o trabalho em madeira.
No ano de 1984, a capela foi substituída pela atual construção, imponente, em alvenaria, que se destaca na paisagem da pequena comunidade.